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英国の問題の変異株について、現在わかっていることがまとまっている
•なぜこの変異株が問題なのか
•どれだけ早く広がっているのか
•英国外に広がっているか
•変異の意味
•ワクチンは効果があるのか、などについて
bbc.co.uk/news/health-55…
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英の変異株に不明な点は多く、杞憂であることを祈るが、疫学・ゲノム配列・周辺の証拠から警戒すべき理由は十分ある
英はシークエンス・統計疫学・感染症に強く、その総力戦でパンデミック当初から日々変異株のモニタリングと性質の検証をしているCOG-UK Consortiumの忠告に基づく対応である点も重要 twitter.com/bbcnewsjapan/s…
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変異株の性質を考えるとき、当然その変異株をもったスーパースプレッダーが感染をたまたまひろげたがゆえに急速に拡大したように見えるだけ、という可能性は検討されている。が、現在のロンドンなどで同株の余りに急速な流行拡大があり、変異株は免疫・生化学的意味がある変異を含む17の変異をためこむ twitter.com/masahirono/sta…
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問題の変異株は英南東部を中心に急増中（紫の線）。英がこの変異株を早期に発見し流行動向を把握できているのは
1.流行初期よりコロナ変異の監視・研究を大規模・包括的に実行してきた努力と
2.たまたま英標準PCRが問題の変異株の変異部分を「ひっかけていた」のでPCRで同定可能だった幸運のため twitter.com/masahirono/sta…
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流行拡大でコロナが多数の人をわたって感染を繰り返すことで徐々に変異するが、それだけではなく、感染が長期化する患者では、おそらく治療の結果として、体内でウイルスの変異・進化を促進することが示されている。つまり、英国型・南ア型に気をとられるだけではなく、国内での変異の動向調査も重要 twitter.com/masahirono/sta…
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英国型・南ア型の変異株は伝染効率が高いのが大きな懸念。これまでのデータからRを0.4~程度おしあげる可能性。これでも対策は一緒だという言説が流れているが、これは正しくない。もし本当にRが0.4押し上がれば、例えば秋の英の封鎖では間に合わず、学校の閉鎖など含むより強力な封鎖政策が必要になる
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問題の英国型の変異株B1.1.7 (VOC202012/01、図の１)はN501Y, del69-70を中心に１７の株特異的な変異をもつ。一方、ウェールズで広がっているN501Y変異株（図の２）はdel69-70をもたず、系統樹上も別の系統。南ア型（図の３）もN501Yをもつが、また別物 twitter.com/firefoxx66/sta…
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コロナ変異株が英・南アで別々に現れたことは、この２国が特別なのではなく、各国でコロナが別の変異を蓄積しているという当然のことを改めて示している。
オリンピックの文脈でいえば、世界中のコロナ変異株を集め、日本で伝染力の強いものを取捨選択することになるという可能性が一つ現実に近づいた twitter.com/bbcnewsjapan/s…
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英国型変異株B1.1.7の流行するイングランド南東部、とくにロンドンでの新規感染者の増加が凄まじい。この２週間で３倍に。検査の陽性率は15% twitter.com/jburnmurdoch/s…
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ロンドンの感染者数が２週で３倍になったが、東・南部を中心とする相当数の行政区で１週あたり新規感染者数は、1000人/10万人以上(＝人口の1%以上が１週間で新規に感染中)に増加。この１週間でロンドン全体で急増している。現在これら急増地域の感染のほとんどが変異株B1.1.7
coronavirus.data.gov.uk/details/intera… twitter.com/masahirono/sta…
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コロナ 変異ウイルス 日本国内で初確認 英国からの複数帰国者 | NHKニュース www3.nhk.or.jp/news/html/2020…
厚生労働省によりますと、空港の検疫所で感染が確認された男女5人について採取した検体を調べた結果、イギリスなどで確認されている変異した新型コロナウイルスに感染していることが確認された
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英国と世界がコロナ変異株に警戒する理由(小野昌弘) - Y!ニュース news.yahoo.co.jp/byline/onomasa…
どうして英国のコロナ変異株がこれほどまでに警戒されているのか、その背景を解説する。
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シークエンスでコロナウイルスのゲノム配列決定した数を英米間で比較。英は米にくらべ圧倒的多数のゲノム配列決定をしており（件数あたり）米の２３倍。英がコロナ変異株の調査研究に強い様子がみえる twitter.com/DrEricDing/sta…
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コロナ変異株にワクチンは効くのか(小野昌弘) - Y!ニュース news.yahoo.co.jp/byline/onomasa…
英国で出現したコロナ変異株に対して現在開発中のワクチンは効果があるのだろうか？現時点でわかっていることをまとめた。
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コロナ「変異種」という単語が頻用されているが、新しい「種」ではないので間違った用語だし、語感からも誤解を招く。英国型などで今問題のウイルスは遺伝子配列が少々変異したものに過ぎず、依然として同じ新型コロナウイルスSARS-CoV-2であることには変わらないので、変異株が正しい用語。
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南アで問題の変異株501Y.V2は第１波中に出現,10-11月に急増, いまは南アのコロナ流行の圧倒的多数を占める.
英国型のB1.1.7変異株と別物であるが, Sタンパクに８つの変異があり, 英国型変異株と共通する変異N501Yをもつ.
南アは現在アフリカ最悪のコロナ流行中．季節は夏
bbc.co.uk/news/world-afr…
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英公衆衛生局の予備的研究によると、変異株B1.1.7は入院患者数・死亡率・再感染率を増やしていない様子、今後のデータが必要だがとりあえずは吉報。
この変異株の一番の問題は、伝染の効率が高い様子であること - 患者が増えれば重症も増える
gov.uk/government/pub… twitter.com/masahirono/sta…
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本日の英国のコロナ新規感染者53,135人で記録更新
現在イングランドだけで20,426人が入院中、４月のピーク19,000人を超える
現在の封鎖を超える制限が必要である可能性ー学校・大学の閉鎖か
ファーガソン教授は、変異株が状況を「疑いなくかなり難しいものにした」と述べた
bbc.co.uk/news/uk-554752…
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先日の記事で、英国は変異株の出現とともに流行拡大がとまらないことから「たとえば学校や大学の閉鎖を含む、より厳格な封鎖になる可能性がある」と書いたが、実際ロンドンをふくむイングランドの多くの地域でロックダウンは継続、さらに１月１８日まで学校・大学が基本的に閉鎖になることが決まった。 twitter.com/masahirono/sta…
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インペリアルのファーガソン教授のグループから
封鎖下での変異株の疫学データ解析により
•変異株VOC202012/01 (B1.1.7)はRを0.4-0.7押し上げると推定
•２０歳未満のひとで特に変異株の流行がひろがっている
→問題の変異株の流行を広げる力が高いことが改めて示される
imperial.ac.uk/mrc-global-inf…
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変異株の伝染効率が５０％高くなるのは、重症化が５０％増えるよりも問題であることについて、@lsthmの数理疫学者の説明
＊要点は、伝染が高まる効果は伝染するたびに上乗せになる＝指数関数にのる＝鼠算式にふえる＝ので、多少の重症化の率の上昇より、はるかに重症患者・死亡者を増やしてしまう。 twitter.com/AdamJKucharski…
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これを踏まえると、英国型変異株B1.1.7 の伝染効率が本当に６−７割高いならば、重症者の絶対数を大きく増やすことが予想され、大きな懸念である。地理的動態・時間的動態の解析から、英国型変異株の伝染の効率がよいことは相当のエビデンスがあるゆえ、南アフリカ変異株とともに警戒する必要があろう twitter.com/masahirono/sta…
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英のコロナ流行データ分析で、第１波のときあと１週間はやくロックダウンしておけば死者は半減していたとする推定
感染者数が指数関数的に増加しているときに早くロックダウンをはじめたほうが、ロックダウンを長期におこなうよりも死亡数を減らす上ではるかに効果的であると
imperial.ac.uk/mrc-global-inf…
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ロンドンにおけるコロナ患者の入院数が急激な勢いで増加中、いまは２週間で倍増している勢い。全入院患者の半数がコロナ患者。
イングランドの他の地方における患者増加も同様に著しい twitter.com/jburnmurdoch/s…
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ロンドンは新規患者数増加も著しいが、検査陽性率が24％し爆発的に上昇中=検査数が感染数の増加においつかない勢いで感染爆発
＊ロンドンとともに変異株流行がはじまった東部・南東部イングランドの増加も著明
＊英国は検査件数を第１波のころより７倍ほどに増やし、1日42万検体コロナの検査をしている twitter.com/jburnmurdoch/s…
免疫学者, 医師
Imperial College London
T細胞免疫・記憶の研究
Tocky開発者 bit.ly/31Fsngi
🇬🇧 @MonoTockyLab
Youtube: bit.ly/3OZHnJ5
note.com/onomasahiro
Blog: bit.ly/3SDQBwp